人类、狗和猪的DNA在基本分子结构上相同：都以A、T、C、G四种碱基组成双螺旋，并将DNA缠绕在组蛋白上，形成染色质和染色体。真正显著的区别主要在染色体数量、基因组序列及其组织方式。若是选研究对象，应按问题决定：研究人类遗传本身选人类数据；关注特定遗传病或犬种差异可选狗；需要研究部分生理过程或转化医学问题时可考虑猪。
先区分分子结构与基因组规模
“DNA结构”可以指不同层级。单看DNA分子，三者遵循相同的碱基配对规则：A与T配对，C与G配对，双链方向相反。进入细胞核后，DNA都与蛋白质结合并折叠包装。不能因为物种不同，就把它们描述成采用了不同的DNA基本构造。
在染色体层面，差别就更直观。通常情况下，人类有46条染色体、23对；狗有78条、39对；猪有38条、19对。染色体数目不同，反映的是长期演化中染色体分合、重排等变化，并不代表狗的DNA“更多”或生物结构“更复杂”。基因组大小也不能直接等同于物种复杂度。
以单倍体核基因组的常见估算值为例，人类约31亿个碱基对，狗约24亿至25亿，猪约25亿左右。具体数字会随参考基因组版本、组装质量和统计口径变化。三者的蛋白质编码基因数量总体都在约两万量级，实际注释结果也会因统计方法不同而有差别。
按相同维度对比人类、狗和猪
| 比较维度 | 人类 | 狗 | 猪 |
|---|---|---|---|
| DNA基本结构 | 双螺旋，A-T、C-G配对；DNA与组蛋白共同构成染色质 | 基本规则相同，细胞核内也以染色质形式包装 | 基本规则相同，细胞核内也以染色质形式包装 |
| 常见体细胞染色体数 | 46条，即23对 | 78条，即39对 | 38条，即19对 |
| 单倍体核基因组大小 | 约31亿个碱基对 | 约24亿至25亿个碱基对 | 约25亿个碱基对 |
| 基因组差异重点 | 与人类个体差异、疾病和性状相关的序列变异及调控差异 | 犬种之间的遗传差异、遗传病变异及选择繁育影响 | 与生长、代谢、生理特征及育种相关的遗传差异 |
| 适合回答的问题 | 人类遗传、疾病机制与个体差异 | 犬类遗传病、犬种差异及兽医学问题 | 猪的遗传育种，以及部分生理和转化研究问题 |
表格中的数字适合做整体认识，不足以判断某一个基因是否相同、某种疾病是否会跨物种对应。即使三个物种有相似基因，基因所在的染色体位置、周边序列和表达调控也可能不同；相反，染色体数目不同，也不妨碍部分基因及其功能在演化中保留下来。
三种对象各有什么优势与限制
人类：研究对象与人类疾病、遗传特征直接对应，结果更便于解释人群中的变异。不过，人类研究需要考虑个体差异、族群结构和伦理要求；单一参考基因组也不能代表所有人的遗传情况。涉及人类自身的问题，优先选择人类样本或人类基因组数据通常更合适。
狗：不同犬种的繁育历史和遗传背景，为研究特定遗传病、性状与群体差异提供了切入点，也适用于兽医学研究。局限是犬种内的遗传结构可能与人群不同，不能把犬类中的基因关联直接当作人类结论；犬种、年龄和繁育背景也需要纳入分析。
猪：猪常用于研究生长、代谢和部分生理过程，也可作为某些转化医学问题的动物模型。它的价值在于特定生理特征与研究问题的匹配，而不是DNA结构与人类完全相同。物种间的基因调控、生理差异和疾病表现仍会影响结果，模型发现需要针对研究目标解释。
怎么选：按研究目标确定对象
- 问题直接针对人类遗传或疾病：优先选择人类基因组、临床或人群数据。狗或猪可以提供辅助线索，但不能替代人类证据。
- 关注犬种、犬类遗传病或兽医诊断：选择狗，并尽量结合具体犬种和相关遗传背景，避免把一个犬种的结果推广到所有狗。
- 关注猪的育种、生长代谢，或适合用猪开展的生理模型研究：选择猪，同时明确模型能够回答什么、不能代表什么。
- 只想比较DNA基本结构：三者没有需要“择优”的分子构造；重点看染色体数、基因组规模和序列差异，而不是把某一种排成结构更高级。
简而言之，三者的DNA共享同一套基本化学结构，差异主要体现在染色体组织、序列和遗传背景。比较染色体数量时，人类、狗、猪分别是46、78、38条；选择研究对象时，则应让物种与研究问题相匹配。研究人类就优先人类，研究犬类遗传问题选狗，研究猪的生理或育种问题选猪，不宜仅凭染色体多寡作决定。